Seksi Pendidikan Madrasah sebagaimana dimaksud dalam PMA No. 13 Tahun 2012 Pasal 430 mempunyai tugas melakukan pelayanan, bimbingan teknis, pembinaan, serta pengelolaan data dan informasi pada pendidikan madrasah.
Berikut ini adalah susunan pegawai pada Sub Bagian Tata Usaha :
| NO | NAMA / NIP | GOL/ RUANG | JABATAN |
| 1 | SITI MUZAYANAH A.M., S.H. | III/d | Kepala Seksi Pendidikan Madrasah |
| 197004121994032005 | |||
| 2 | SUTOTO, S.H., MM | III/d | Pengembang Sarana dan Prasarana Seksi Pendidikan Madrasah |
| 196511171988031002 | |||
| 3 | FAROKHAENI | III/b | Pengadministrasi Seksi Pendidikan Madrasah |
| 197401151994012002 | |||
| 4 | DEWI MEGAWATI, ST | III/a | Pengolah Data Beasiswa dan Bantuan Seksi Pendidikan Madrasah |
| 198011212011012006 | |||
| 5 | SRIYATNO | III/a | Pengolah Data Seksi Pendidikan Madrasah |
| 198301152005011001 | |||
| 6 | WIWIK MARET TINI | II/c | Pengadministrasi Seksi Pendidikan Madrasah |
| 198303212006042015 | |||
| 7 | EKO PRASETYO | II/b | Pengadministrasi pada Seksi Pendidikan Madrasah |
| 198411112007011001 |
